锅炉热效率与受热面布置、保温材料的性能、燃烧机的匹配等有关。对于卧式内燃燃气锅炉而言，燃料燃烧后的热损失有排烟热损失(q2)、化学未完全燃烧热损失(q3)、锅炉表面散热损失(qs)。从国产或进口燃气锅壳热水锅炉的实际情况看，排烟温度一般在170℃以上，排烟热损失(q2)在5—8%;化学未完全燃烧热损失取决于燃烧机的效率，一般为0.5—1%;锅炉表面散热损失一般在1—2.0%。这样锅炉热效率在90—93%均属正常。在这个前提之下，尽量选择热效率高一些的锅炉。
以2.8MW燃气锅炉为例，热效率每提高一个百分点，每小时可节约3—4m天然气，锅炉每天按运行10小时计算，一个采暖期少烧天然气1万立方米左右。热效率对燃料的节约是一个重要的性能指标。一些用户希望锅炉热效率越高越好，但燃气热水锅炉热效率超过93%，要么不可能，要么就要付出其他高昂代价来换取。
一些进口锅炉厂商或代理商，在向用户介绍时，宣称其锅炉热效率可达到95%以上，甚至超过了100%。因为热效率高，对用户极具吸引力。热效率95%以上甚至超过100%，是一种计算方法的问题。燃料的热值分高发热值和低发热值。高发热值是指燃料完全燃烧后，包括烟气中水蒸汽冷凝成水所放出的潜热在内的整个热量。燃料的低发热值是指燃料完全燃烧后不包括烟气中水蒸汽的冷凝热量所发出的热量。
在进行热效率计算时，无论国内还是国外均是以锅炉输出的有效利用的热量与燃料的低发热值百分比。在有效利用的热量中，国内不考虑烟气中水蒸汽凝结时释放的潜热(水蒸汽凝结所放出的潜热约为低发热值的10%)。若利用烟气中水蒸汽凝结放热必须要将烟气温度降低到烟气中水蒸汽露点以下，需要在尾部烟道或烟囱中设置造价昂贵的不锈钢换热器。换热器一方面降低了烟温，一方面吸收了水蒸汽冷凝释放出的一部分潜热。之所以采用不锈钢换热器，是因烟气中的碳氧化物或氮氧化物遇水形成酸，有强烈腐蚀作用。
国外一些锅炉厂商热效率计算方法以高发热值为基础，减去各项热损失后的热量与低发热值的比值。这就是国外一些厂商宣称其锅炉热效率可达95%以上甚至超过100%的奥秘。但国外锅炉厂商在锅炉报价中是不含尾部烟道不锈钢换热器的价格的，如果用户需要时，需另外再付不锈钢换热器价钱。